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黄颡鱼的性别主要可以从第二性征加以鉴别，雌体腹鳍后面依次是**、生殖孔和泌尿孔，其中后面两孔靠得很近。性成熟的雌亲鱼体形较短粗，腹部圆而饱满，且富有弹性，将雌亲鱼从背部向上托起，外观上可以看到比较明显的卵巢轮廓，生殖孔明显，红肿略外突。雄性个体腹鳍后面依次是**、生殖突，生殖突末端的开口是泄殖孔。性成熟的雄亲鱼个体一般大于雌亲鱼个体，在臀鳍前**后有明显的0.5～0.8厘米生殖突起，呈乳头状，略显红色。
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