第二个时期，生物分子方面的研究得到了空前的发展。但关于月季的科学研究不多，这种情况可以从过去的《植物育种》和《园艺学文摘》两种杂志中看出，在它们当中每年数以千计的文献里，很少有关于月季的文章。关于月季的科学研究工作，主要集中在分类细胞学、生理学、形态学、生长条件、变种和砧木研究上，育种研究的目标在于性状遗传、杂交育种程序的简化及提高直接选择和间接选择率，关于低耗能与抗病虫害品种的研究则较少，而且远远落后于果树。例如，几乎所有的育种工作是局限在大学或研究所里。
第二个时期，有二个重大发现。首先，连续开花，大花品种的育成，它是由皮内特在1900年育成的。它标志月季种间杂交定向育种的**次成功。
第二个重大成果，是在1920年，古老矮壮品种的育成，“pompondeparis"，在瑞士重新被发现这个新种类现命名为R．roulettiiCorrevon，是现代一些微型月季的起源。