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蟑螂的医学重要性日益受到重视。它们携带能致病的细菌、病毒、原虫、真菌以及寄生虫蠕虫的卵，并且可作为多种蠕虫的中间宿主。
蟑螂已被证明携带约40种对脊椎动物致病的细菌，重要的如引起麻风的麻风分支杆菌，引起痢疾的志贺氏痢疾杆菌，引起小儿腹泻的志贺氏副痢疾杆菌，引起尿道感染的绿脓杆菌，引起泌尿生殖道和肠道感染的大肠杆菌，引起肠道病和胃炎的多种沙门氏菌如乙型伤寒沙门低菌、伤寒沙门氏菌等。此外，蟑螂尚可携带引起食物中毒的多种致病菌，除了上述的绿脓杆菌、大肠杆菌等外，还有产气荚膜梭状芽胞杆菌、粪链球菌等。此外，蟑螂尚可人工感染导致亚洲霍乱、肺炎、白喉、鼻疽、炭疽、结核等病的细菌以及O175等。
蟑螂也可携带多种原虫，其中有4种对人或动物有致病性，如痢疾阿米包囊、蓝氏贾第鞭毛虫包囊等。